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中国科学院水生生物研究所专家牵头编撰了全球最大的《鱼类遗传词典》。
2025-11-13

湖北日报讯(记者李玉林、通讯员孙慧)11月6日,由中科院水生生物研究所科研团队牵头的“万条鱼类基因组计划”(Fish10K)第一阶段研究成果正式发表在学术期刊《创新》上。该成果基于对数百种新鱼类的从头测序,整合分析了464种硬骨鱼类的全基因组数据,打造了迄今为止全球覆盖范围最广、精度最高的鱼类基因组图谱,填补了全球鱼类基因组研究的多项空白。鱼类约占世界脊椎动物总数的一半,其基因组数据库在脊椎动物领域排名第三,仅次于哺乳动物和鸟类。然而,近20年来,世界各地的鱼类基因组研究始终存在“差异差距”。目级的三个类群的基因组数据长期缺失,犹如进口。蚂蚁拼图丢失了。为了弥补这一不足,何顺平团队与国内外多家领先研究机构合作,开展跨区域、跨学科的科学研究。科研团队走遍了极端环境的各个角落,从青藏高原内部,到海拔4000多米,再到“地球第四极”的马里亚纳海沟。他们首先发现了高原鱼类的同域物种形成现象,阐明了深海狮子鱼细胞适应高压环境的分子机制,并在八次载人水下潜水中采集了深海鱼类样本。日本的深海鱼类研究从零开始。 “此次建成的464种全基因组比对芯片就像一本精准的‘鱼类遗传词典’。”何俊平说,该芯片覆盖了硬骨鱼全部44目,其规模和精度可与硬骨鱼基因组工程相媲美。哺乳动物和鸟类。这不仅在丰富度上超越了其前身,而且代表了迄今为止最大、最全面的鱼类基因组资源库。这项研究的几个发现推翻了传统的理解。研究团队首次在硬骨鱼中鉴定出约3万个“高度保守的元件”(可以理解为基因的“不可改变的核心指令”),并揭示其中1689个是硬骨鱼特有的“基因开关”。这些精确的调节器控制着鱼类主要器官的发育,产生从肺鱼到深海狮子鱼的形态多样性。我会的。对318万个碱基序列重建的鱼类“家谱”分析表明,电鳗并非鲶形目的“近亲”,电鳗和电鳗的能量产生器官是独立进化的结果。据了解,这一目标是10,000鱼类基因组计划旨在完成世界三分之一鱼类的基因组分析。第一阶段成果历时6年完成,由中国科学院水生生物研究所、华大基因青岛研究院、西北工业大学等部门共同努力完成。下一步,团队计划加速类群在“科”层面的基因组覆盖,为研究脊椎动物进化和探索生态适应机制提供更可靠的数据。

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